当军师府出现之后，很多人不理解为什么刘澜会授予军师府指挥军队的全权，这等于将军师府拔高到了与将军府一样的位置了吗，很多人尤其是那些武将们肯定会有不满，因为这会让他们感觉自己降了一级。
毫无疑问他们首先都是将军府的将领，之前是受刘澜直接领导，而现在却要受徐庶指挥，所以很多人肯定有不满的地方甚至在私底下抱怨，甚至连徐庶自己都感受到了前所未有的巨大压力，来找到刘澜，他不希望在这个时候处在风口浪尖上，这会让他的压力无比巨大，毕竟这些人里如果只有张颌太史慈们，那他的压力还会小那么一些，可如果连关羽赵云都有相同的想法，那他就不能不重视。
可刘澜一句话就打消了徐庶的顾虑，或者说刘澜非常严肃的一句话就让徐庶闭了嘴，他告诉徐庶首先要明白一点，他是授予军师府指挥军队全权，而不是授予徐庶你指挥军队全权，这个关系要明白，换言之是军师府有这个权利而不是某一个人。
其次，军师府有指挥军队全权的权利，但是他是隶属于将军府麾下的，与领兵大将是平等关系，而徐庶们或者说军师府指挥军队全权的权利与个领兵大将的关系是指导关系，而不是你徐庶拥有了指挥的权利。
第三，军师将军是一个职务而不是一个人，他可有是你徐庶也可以是陈宫更可以是关羽是赵云是张飞，军师将军这个人是会变的，但是军师府的职能却是不会变的，而现在很多人都在盯着你这个人，首先是他们自己的问题，所以军师府要去解决去澄清，更要去让人们理解他的职能。
毕竟军师府对很多人而言，是陌生的，以前从来未有过的机构，大家对其有误解再正常不过了，可你身为军师将军，我本以为你会比他们更清楚军师府的意义，但没想到连你自己居然也犯了与他们类似的错误。
刘澜有些生气了，但他并没有怪那些不理解军师府的将领们，而是因为徐庶，因为刘澜对徐庶对军师府抱着很高的期待，可是刘澜很快就又冷静了下来，因为他好像忽然反应了过来，好像不仅是将领们包括张昭这些内阁甚至是徐庶都一样，而刘澜很容易用自己的思想去带入，认为他们会明白自己的想法，这样的心思本来就是错误的，所以军师府第一次从刘澜口中给出了他的一个最为明确的定位很快便又由徐庶为代表们将军师府的职责转达给了所有人。
1：军师府具有全军最高的实权指挥权。2：军师府是以协调各都督府作战居中协调机构。3：军师府是以将军府、征东将军刘澜身边的参谋机构，以顾问形式出现。
三大职能，很多人会不理解，但其实又非常好理解，先从第三点来看，首先军师府是刘澜身边的军师与参谋，指定作战计划，提供战斗建议的智囊。其次他是协调各都督府作战的协调机构，简而言之如果刘澜要对徐北用兵，那么首先肯定是动用广陵的赵云部，再调张辽所在的寿春部甚至还有可能包括将军府的关羽部，那么作战之时如何能够保证三方行动一致，不出现重复甚至是乌龙事件，这就是军师府存在的价值。
而最后一点，也就是用军师将军指挥作战，虽然这个先例还没有开，不管是九江之战的黄忠还是荆南之战的刘澜亲自出马，所以徐庶始终都是以第三点参谋的形式出现在刘澜身边，可如果刘澜没有亲自来到荆南的话，那么这一仗在荆南的最高指挥官就会自然变成徐庶。
简单说起来，就是军师府在保留以前辅助与辅佐的职能，只提供建议而无权对军队实施指挥，变成了随时对最高权力者提供建议，同时还获得了作战计划制定权和战时军队指挥权，而从这一刻开始，军师府从古老的智囊模式正式进入现代标准的总参谋部模式。
刘澜对军师府是非常期待的，可以说从第三次徐州之战结束，从广陵返回秣陵到前往荆南，这段时间他的心思一直都在军师府上，在他的心目中军师府不仅是现在包括未来他的存在就是军队的大脑，也必须发挥出大脑的职能。
但是眼下刘澜不可能直接就拿九江之战乃至孙策让他去练手，或者说现在的徐庶还不具备刘澜给他如此大的权利，或者说现在真要让徐庶去指挥，不管是关羽还是赵云，他能指挥动哪一个？现在的刘澜治下说实在话这帮骄兵悍将除了他自己，就徐庶的资历还真镇不住这个场面。
但为什么刘澜还要给军师府加上这个权利呢，他就是要让所有人都明白一点，那就是徐庶代表了他，你们无须理会他的职务和官职的大小，但只要明白一点那就是他代表了刘澜，服从他的命令就是在服从自己的命令就行了，而现在刘澜带着徐庶就是在让所有人习惯徐庶的角色变化，和接受军师府对作战计划制定的权威性。
树立军师府的权威以及树立军师将军的权威将成为接下来很长一个时期的重中之重，毕竟这样的机构是以前从来都没有出现过的，刘澜必须用最快最暴力最简单的方式介绍给所有人，并让他们理解和接受。
这一切都是刘澜在总结了宋朝的整体经验之后得出来的结果，在他看来宋朝的那些皇帝们只要不瞎指挥，枢密院如果能有真正的职业军人而不是不懂一点军事的文人的话，那么情况将完全是另外一个样子。
所以刘澜正是在总结出这一点之后，对军师府提出的重要要求就是军师府要招募专业的军事人员，比如军事测绘人员，招收训练有素的参谋人员，最行而有效的方式就是在各大都督府、各大将领身边设立军师将军、军师祭酒、军师校尉、这样一来就保证了军师府会有源源不断的人才选拔体系。