在日本本土遭受美军空袭之前，尽管联合舰队于3月份就提出了攻占中途岛的作战方案，但日军大本营却并未同意。海军部的反对理由很明确：攻占中途岛本身并非难事，问题在于其后的补给运输困难，特别是在美军反攻的时候，即使联合舰队反应迅速，仍无法跨越辽阔的海域及时增援的。况且，在当时东南亚、印度洋以及澳洲方向的战事仍在进行的情况下，日本海军也不应将力量进一步分散使用。

就中途岛作战与否的问题，日本海军部和联合舰队发生过多次争论，但一直没有得到明确结果。直到杜利特空袭日本本土，一力坚持有关作战方案的联合舰队有了更为充分的理由后，争论才得以解决。.

空袭过后，山本五十六在大本营会议上坚定地表示如果帝国海军不迅速夺取中途岛并加强对东部海域的警戒，那根本无法有效地防范美军战机对帝国本土的反复空袭！而要想确保本土安全，就必须攻占中途岛、阿留申群岛等中太平洋岛屿，并以之为前进基地，将美军海上力量阻挡在东太平洋地区！”

为了能让大本营同意立即实施联合舰队所提出的作战方案，山本甚至不惜以辞职相胁。但因日本海军主力已在海上奔波太久，有关作战舰艇亟需维修且作战人员也过于劳累需要休整，永野修身经过考虑后，最终同意在6月7日实施中途岛登陆作战计划。

至于选择6月7日，也是日军大本营经过仔细考虑的。当天天亮前有残月。利于舰载机编队和登陆部队在夜间行动。而从战术上来看，如果过了这一，那么原定的作战行动很可能要拖延上一个月。这能让美军赢得更长的准备。而对日军不利！

不过，登陆作战虽然确定在6月7日，但有关的空袭作战却要提前发动。负责指挥日军航母编队的南云忠一将空袭中途岛的定在了6月4日凌晨。

4日凌晨四点半，随着进攻中途岛命令的下达，正迎风全速航行在中途岛西北四百多公里海面上的四艘日军航母，全部开始了紧张的起飞作业。第一批攻击中途岛的一百零八架战机呼啸着腾空而起，在调整方向后朝中途岛扑去。

一个多小时后，就在中途岛美军从雷达上敌机临近并匆忙组织战机起飞迎敌的时候，正在赤城号航母上等待空袭结果并准备随时派出第二批战机的南云忠一却突然收到了“伊—169号”潜艇发来的紧急电报我舰于中途岛正北二百里海域敌军航母编队。共有两艘航母、六艘巡洋舰和九艘驱逐舰。这肯定是敌第十六特混舰队！它们正以二十五节的速度朝西北方向行驶……我们被命中了！……”

按照命令，伊169号潜艇应该与其他几艘潜艇负责在北纬19度30’、西经167度和北纬23度30’、西经167度之间进行警戒，南云忠一实在闹不明白这艘潜艇会跑到北面去了！

但对于伊169号冒死发回的电报，南云忠一并不敢轻忽，连忙命令道派出一个中队的战机去北方侦察，确定情况是否属实！航空战舰编队立即加速规避。航向正东！取消原定对中途岛的第二次攻击，做好攻击敌军航母编队的准备！另外。做好指引第一批战机攻击后返回的准备！”

“该死的！那里会出现日本人的潜艇！”破译伊169号潜艇电报后，在珍珠港坐镇指挥的尼米兹大惊失色，连忙命令道。“快给雷蒙德发报，第十六特混舰队已被敌人，命他们做好迎敌准备！”

“不！将军，我们应该趁敌人首批战机空袭中途岛而他们第二批战机去寻找第十六特混舰队的有利时机，让雷蒙德出动全部战机去对付日本鬼子的航母编队！”富有攻击精神且因失去两艘航母而被尼米兹留下来辅助作战指挥弗莱彻却提出了不同意见。“日本人那里可是四艘航母！而且，现在正是他们空中力量分散的有利时机，哪怕我们再损失两艘航母，可只要能一举干掉南云的航母编队，我们就赢定了！”

尼米兹定定地看向弗莱彻，而弗莱彻也毫不畏惧的迎向尼米兹的目光，并坚定地说道将军，这是我们的机会，下命令！”

“弗兰克，这是赌徒式的疯狂！”尼米兹深呼一口气，嘴角翘了翘，拍了拍弗莱彻的肩膀后，又道，“不过，这个意见我喜欢！我们确实已经没有更多、更好的选择了！”

随即，按照弗莱彻的建议，尼米兹给正率领第十六特混舰队接近日军航母编队的斯普鲁恩斯下达了攻击作战命令。

“这是孤注一掷！”接到尼米兹的命令后，斯普鲁恩斯叹道，“既然我们已被该死的日军潜艇，那我们也没有别的选择了！命令舰载机全部起飞，去击沉日本人的航母！在攻击任务完成后，各载机不必返回母舰，直接降落到中途岛机场。载机起飞后，舰队航向调向东北，做规避机动！同时，命令各舰做好防空准备！”

此时，已率“潜流”作战部队进至中太平洋海盆的匡海成在截获并破译日、美双方的电报后，不禁笑道虎鲨三号昨天在中途岛以南干掉了小鬼子一艘潜艇，今天返航时却又遇上了美军航母编队！愣是在中途离场前还调动了日、美双方，这种运气简直逆天了！”

“接下来就看大鼻子和小鬼子如何斗法了！而我们能得以旁听全程，这耐心和运道也算不坏！”章帆笑意盎然地说完后，又感慨道，“通过这些天的经历。我算彻底明白了当初为何坚持潜艇兵必须要通过狙击训练了！没有足够的耐心和坚韧的神经，在这铁罐子里还真呆不住！”

因匡海成等人的干预，确切地说是三号艇艇长彭定远冒充日军伊169号潜艇所发的那封电报。彻底地打乱了日、美双方原定的作战部署，使其彼此间的航母编队开始了原本历史上并未出现的“王对王”的正面交锋！

尽管美军有情报和雷达方面的优势，但在双方都已确定对方航母编队位置的情况下，日军凭借其载机数量和零式战机性能等优势，还是锁定了胜局！

连侦察机在内，日军第二波用于攻击美军航母的共有一百六十四架飞机，而美军两艘航母上共有一百六十二架战机，双方基本持平。

若是双方战机在空中遭遇的话，日军凭借零式性能优势。很可能会使美军孤注一掷式的攻击化作影。但美军却凭借其情报优势，预先判断出日机的飞行路线，进而成功的避开敌机并飞临日军航母上空展开攻击！这就形成了双方各自攻击，又各受攻击的局面！

在头一回合的交战中，日军加贺号、飞龙号两艘航母被疯狂攻击的美军战机击沉，南云的旗舰赤城号航母也遭受重创。仅有苍龙号避过一劫，且另有一艘重巡洋舰、三艘驱逐舰被击沉。而在日军第一波攻击中。美军企业号航母被击沉，大黄蜂号则被重创。

但随着袭击中途岛的日机返回航母加载武器并加入对第十六特混舰队攻击后，大黄蜂号也遭到了沉没的命运。同时沉没的还有两艘重巡洋舰、一艘驱逐舰。另外几艘战舰也遭到不同程度损伤。

不过，日军虽然在航母对抗中赢得了胜利，但在美军向中途岛增派陆基航空力量的情况下，加上幸存的几十架舰载机也以从岛上机场起飞对海攻击，南云忠一权衡利害。不得不向后方大和号战舰上的山本发报，称“已确认击沉敌军两艘母舰、两艘重巡洋舰和一艘驱逐舰，取得对敌航母舰队作战的胜利。但帝国母舰沉没两艘、重创一艘。凭现有的海空力量，无法在与敌人不断得到加强的陆基航空力量的作战中确保胜利，登陆作战已难以实现……”